Hat eine Karies den Zahnnerv erreicht, ist in der Regel eine Wurzelkanalbehandlung erforderlich, um den Zahn in der Mundhöhle zu erhalten. Hierbei ist es essentiell, alle Kanäle des Zahnes zu behandeln, da sonst ein Risiko der erneuten Infektion des Wurzelkanalsystems besteht. Da die Kanäle leider nicht gerade sind und viele Verzweigungen aufweisen, wird immer zusätzlich mit einer antibakteriellen Spülung gearbeitet, die das gesamte System desinfiziert. Entscheidend für den Erfolg einer Wurzelkanalbehandlung ist auch das Erzielen einer dichten sowie nicht zu kurz oder zu langen Wurzelfüllung. Dafür sollte bei der Präparation der Kanäle eine digitale und computergestützte Bestimmung der Wurzelkanäle stattfinden, welche zielgenau an die Wurzelspitze die Instrumente bringt. In der Regel dauert eine Wurzelkanalbehandlung zwei bis drei Sitzungen.